Ówczesny szef Pentagonu Leon Panetta i sekretarz stanu Hillary Clinton otwarcie przyznali zaśługę Afridi w likwidacji bin Ladena. Operacja Stanów Zjednoczonych, przeprowadzona bez wiedzy władz pakistańskich na ich terytorium, wywołała ostrą krytykę Islamabadu pod adresem Waszyngtonu i poważnie pogarszyła stosunki dwustronne. Później, zgodnie z wyrokiem pakistańskiego sądu, Afridi został wysłany do więzienia.
„Pod koniec grudnia 2017 roku pakistański wywiad (ISI) od swojego informatora dowiedział się o planach ucieczki doktora Szakila Afridi z więzienia w Peszawarze, a następnie plan został udaremniony przez ISI” — powiedziało źródło.
Według niego, jeden z informatorów ISI poinformował o przygotowaniu ucieczki i o tym, że ktoś interesuje się planem więzienia, w związku z tym „Afridi został przeniesiony w bezpieczne miejsce, którego nie podano do wiadomości”.