12:47 07 Sierpień 2020
Nauka I tech
Krótki link
Koronawirus na terenie Rosji (47)
0 130
Subskrybuj nas na

Centrum Biotechnologii Algorytmicznej Uniwersytetu Państwowego w Petersburgu stworzyło moduł, który pozwala odszyfrować genomy koronawirusów, podało biuro prasowe uniwersytetu.

„Nowe opracowanie Centrum Biotechnologii Algorytmicznej na Uniwersytecie Państwowym w Petersburgu, nazwane coronaSPAdes, umożliwia zbieranie genomów wirusów RNA, głównie koronawirusów. Według wstępnych danych możliwe było już odtworzenie sekwencji genomów nieznanych wcześniej koronawirusów” - czytamy w raporcie.

Moduł coronaSPAdes to specjalny tryb kolektora SPAdes (Saint Petersburg Assembler), który umożliwia dekodowanie genomów żywych organizmów, w tym wirusów.

Jak zauważa petersburska uczelnia, moduł coronaSPAdes uwzględnia specyfikę danych sekwencjonowania RNA, a także wdraża unikalne rozwiązania algorytmiczne mające na celu poprawę odtworzenia sekwencji genomu koronawirusa.

Podejścia określone w coronaSPAdes mogą być wykorzystane w przyszłości do opracowania nowych kolektorów z wykorzystaniem informacji o strukturze innych rodzajów genomów.

Opracowanie pierwszej wersji tego modułu zajęło około dwóch tygodni, a teraz jej twórcy zajmują się ulepszaniem kolektora. Według nich moduł coronaSPAdes umożliwia odtwarzanie genomów koronawirusa „znacznie wydajniej i lepiej niż podejścia alternatywne”.

Na przykład zebrano pełnowymiarowe genomy z niektórych zbiorów danych, zgodnie ze wstępnymi danymi z nieznanych wcześniej koronawirusów

- informuje uniwersytet.

Wcześniej amerykańscy naukowcy zidentyfikowali sześć głównych grup SARS-CoV-2, krążących obecnie na świecie. Naukowcy opracowali algorytm do szybkiej izolacji sekwencji genomów i wykorzystali go do badania ponad 10 tysięcy próbek SARS-CoV-2 z różnych regionów świata.

Tematy:
Koronawirus na terenie Rosji (47)

Zobacz również:

Odra „przegrała” z koronawirusem: ogromny spadek zachorowań w Polsce
Rosja: zmarło 135 osób zakażonych koronawirusem. Najwięcej w Petersburgu
Tagi:
Rosja, technologie, epidemia, nauka, koronawirus
Standardy społecznościDyskusja
Komentarz przez SputnikKomentarz przez Facebook
  • Komentarz