08:46 27 Luty 2021
Nauka I tech
Krótki link
260
Subskrybuj nas na

Amerykańscy genetycy odkryli kilkaset wcześniej nieznanych genów w najmniej zbadanych częściach ludzkiego genomu. Okazało się, że ponad 50 z nich wytwarza białka biorące udział w rozwoju komórek nowotworowych. Wyniki badań zostały opublikowane w czasopiśmie „Nature Biotechnology”.

W tej chwili w ludzkim genomie zidentyfikowano około 20 tysięcy genów. Wczesne analizy sekwencji ludzkiego genomu sugerowały istnienie ponad stu tysięcy genów kodujących białka, ale dalsze badania wykazały, że większość z tych genów-kandydatów prawdopodobnie wytwarza niekodujące RNA, fragmentowane komplementarne klony DNA i RNA, wyrażane na nieistotnych poziomach.

Aktualna baza danych projektu proteomu ludzkiego NeXtProt zawiera około 17 600 genów kodujących białka potwierdzonych metodą spektrometrii mas i około 2 100 niepotwierdzonych genów kodujących białka.

Niemniej jednak jest coraz więcej dowodów na to, że translacja zachodzi w genach, które są obecnie opisywane jako niekodujące RNA lub pseudogeny, a także w niektórych regionach nieulegających translacji ma jednak miejsce translacja, czyli proces syntezy białka z aminokwasów na informacyjnym (matrycowym) RNA przez specjalne organelle komórkowe rybosomy.

Jednak do tej pory nie było systematycznego eksperymentalnego potwierdzenia, czy białka powstałe w wyniku takiej translacji są biologicznie funkcjonalne.

Naukowcy z Uniwersytetu Harvarda i Massachusetts Institute of Technology – największego ośrodka genomiki i realizacji Human Genome Project – przetestowali eksperymentalnie 553 kandydujące geny, za które uznali za otwarte ramki odczytu (Open Reading Frame, ORF) – sekwencje nukleotydów w długim niekodującym RNA.

Kandydujące geny wybrano na podstawie opublikowanych danych przewidujących ORF, potencjalnie zdolne do kodowania białek aktywnych biologicznie. Jednocześnie z analizy wyłączono pseudogeny i ORF, które są wariantami znanych już regionów kodujących białka.

W doświadczeniach dotyczących ekspresji ektopowej – ekspresji genów w nietypowym miejscu w organizmie – 257 ORF wykazywało oznaki ekspresji białka, a 401 wywołało zmiany w ekspresji genów. Spośród nich 57 przyczyniło się do żywotności ludzkich komórek rakowych.

W szczególności naukowcy odkryli, że jedna z tych ORF, G029442, koduje bogate w glicynę białko zewnątrzkomórkowe-1 (GREP1), które ma zwiększoną zawartość onkogennej cytokiny GDF15 i jest silnie wyrażane w raku piersi. Zablokowanie go specjalnym inhibitorem złagodziło efekt rozwoju komórek rakowych u 263 linii.

Autorzy uważają, że biologicznie aktywne białka wyrażane przez niekanoniczne ORF mogą być potencjalnymi celami dla opracowania nowych metod w leczeniu raka.

Zobacz również:

Po mamie czy tacie? Naukowcy ustalili, który rodzic daje dziecku więcej genów
Modyfikacja genów kosmonautów: Nie ma gwarancji, że nie będzie skutków ubocznych
Tagi:
genom, geny
Standardy społecznościDyskusja
Komentarz przez SputnikKomentarz przez Facebook
  • Komentarz